Το μουσείο βρίσκεται πολύ κοντά στο λιμάνι του Πρίνου. Στον δρόμο προς το χωριό Ραχώνι, στα 500 περίπου μέτρα από την διαστάυρωση της Σκάλας Πρίνου στρίβετε δεξιά αμέσως μόλις περάσετε τον Μελισσοκομικό Συνεταιρισμό, και σε περίπου 100 μέτρα φτάνετε στην είσοδο του κτήματος που φιλοξενεί τα Βιολογικά Ελαιοτριβεία Θάσου και το Μουσείο Ελιάς και Ελαιόλαδου.